ニワトリ	ウズラ
野生原種高度近交化系長期閉鎖系閉鎖系 疾患モデル系育成系TGニワトリ 始原生殖細胞株（Primordial germ cell lines）	標準系大型系 疾患モデル系 ミュータント系TGウズラ 別種のウズラ マイクロサテライトマーカー mtDNA多型情報 遺伝的多様性アリル頻度分布図 血液生化学データ
表現型一覧 遺伝的多様性接種中のワクチン 血液生化学データ

ウズラマイクロサテライトマーカー

Kawahara-Miki et al. (2013)にて作製された100個のウズラ用マイクロサテライトマーカーのリストですLocus Nameは「染色体番号_物理的位置（bp）」として表記してあります。
物理的位置は東京農業大学のウズラゲノムデータベース（http://www.nodai-genome.org/cgi-bin/gb2u/gbrowse/NGRC_Chicken-DB/）に基づきます。（＊ただし、データベースの更新により位置は随時かわります。）
また、各マーカーの位置をニワトリゲノム上にマップした図を、染色体ごとに表示しています。

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｜ chr.09 ｜ chr.10 ｜ chr.11 ｜ chr.12 ｜ chr.13 ｜ chr.14 ｜ chr.15｜chr.16｜
｜ chr.17 ｜ chr.18 ｜ chr.19 ｜ chr.20 ｜ chr.21 ｜ chr.22 ｜ chr.23｜chr.24｜
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chr.01

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>01_001112334	(CA)11	AGGTCTTTTCCAGCCTTAAT	20	CTATTGGGTGATGTGTCCTT	20	55	118 - 120
>01_023572982	(CA)10	AGGTAGGAAGGAAGGAACTG	20	TTGCTCTTGTTTTGTGTCAG	20	55	158 - 160
>01_052831106	(CA)9	TTCAGATGACTGTGTTTTGC	20	GGGCTTTTATTTCCTTGTCT	20	55	68 - 70
>01_089677546	(CA)14	AAGCCTGGAGACATAACAGA	20	TGTTGCTTAGCCCTGATAAT	20	55	196 - 213
>01_106286693	(CA)17	CCACAGGGTTTCAACTGAGG	20	GGCCTGCAAATGCCTTAAA	20	60	119
>01_150288892	(CA)19	TGCCTGGATTGAGGATTAGC	20	AGCTTTTGCTCCCTGTGTGT	20	60	101
>01_178622103	(CA)12	CAACGTAAACAATGCACAAC	20	TGCATGAAGCTCTGTTAGAA	20	55	162 - 167
>01_199572078	(CA)16	CTCTTGTAACGTGTGAAGCA	20	TCAAGGAGGTGGTATTTGTC	20	55	205 - 215

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chr.02

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>02_001318108	(CA)19	GAGGATTTGTGTCCAACATGG	21	TGTGCAAAGGATGACCAAGA	20	55	180 - 198
>02_017229581	(CA)7	CGAACAAATCTGGTAGGTGT	20	GCTTCTTGAATTAGGTGTGC	20	55	267 - 269
>02_017378655	(CA)10	ATAACTCCTGATGGCAACAC	20	GTTTCATACAACCACCTGCT	20	55	225 - 264
>02_034360168	(CA)15	AGGACAACCGACCTAAACTT	20	AGGAAGAGGAAAAATGGGTA	20	55	243 - 250
>02_035008254	(CA)07	AGATGTTACGCTGGCATTAT	20	TCTAAGGCTGTGCTTATGGT	20	55	153 - 154
>02_048838631	(CA)7	GCAGAAATTACCCCACAGGA	20	AAGGTGATCTTGCCTGAGGA	20	60	125
>02_060785720	(CA)22	TGCCCATCTTCCACCTAAAG	20	AACACCTTACGGCTGAATGC	20	60	121 - 128
>02_087083826	(CA)22	ACCTTATTTTCTGCAGCACT	20	GGAATGCAACAAAATCTCC	19	55	96 - 122
>02_120254783	(CA)8	TTGAGGCTCTGGATAACACT	20	GCAATCTTTTATCTGCTGCT	20	55	186 - 190
>02_153538038	(CA)9	AGCAAGGTCATCATTAGCAT	20	CTTTGAGTATTTCCCCCTTT	20	55	271 - 281

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chr.03

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>03_000818927	(CA)7	GTGAATGAAAACACACAGCA	20	TCCATTCTAAGTTCCAAAGC	20	55	295 ‐ 312
>03_026500324	(CA)15	TGGCCAGGAATAGTGAGGTC	20	TATTTTGCGTTGTGCTTTGG	20	60	192 - 193
>03_028741324	(CA)17	CTAAGCCTTGAAAACCTCTG	20	GGCAATATGTTTGACAGGAA	20	55	349 - 354
>03_055637427	(CA)12	AGGGAAGCTAACTCCAGAAC	20	TGCCAGTAGTTTGTCAAGAA	20	55	185 - 193
>03_084694033	(CA)12	AAGAGGAACAAACGACACTG	20	ATTGCATCTTGGCTCATATC	20	55	239
>03_111029449	(CA)10	GAAAGAAGGAAACAACCACA	20	ACGATGCAGAGGTATTTTGT	20	55	135 - 162

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chr.04

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>04_000875758	(CA)18	TCATCTGCTGCCTGAAGT	18	AATATCACCTGTGCTCTGCT	20	55	84
>04_023898615	(CA)12	GCATGATATGGAGCATATTG	20	TGTGAAGTGTTCACTGTGTTG	21	55	129
>04_046020835	(CA)36	TATCTGATATGCACCCACAC	20	GTTTAGATTGAAGCCAGCAC	20	55	201
>04_064546837	(CA)9	GGCACAGACACACACACACA	20	TGGAGAGAAGGAAGGTTGGA	20	60	112 - 128
>04_091270131	(CA)7	GGCTGAACTTTGACTTTGAC	20	GATCTTCTTGGGACTCTTCC	20	55	124 - 126
>04_092083578	(CA)14	GCACAAGTCCAATCTCATCT	20	GAAAGAATTGGAGAAACGTG	20	55	235 - 270

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chr.05

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>05_030612908	(CA)18	TCCGTGTGACATCTTAACAA	20	GGCGTGAGTGCTCTAAGATA	20	55	166
>05_060973011	(CA)10	AAGCGCTCCATCATACACT	19	CAAGAGGTTAAAAGCAAGGA	20	55	122 - 129

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chr.06

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>06_002529991	(CA)14	TCATGGTAAGTGAAGCACAG	20	AAGCAGTTGCTTTGTGGA	18	55	91 - 110
>06_016019207	(CA)7	AGCTATCCTTCAGCAGTGTGG	21	AGTGTCAGGCCTGGGTTATG	20	60	229 - 233

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chr.07

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>07_000101774	(CA)17	TGGTTGTCTCAATACGTCAA	20	GAAGGCTTTTAGAGTGCTTG	20	55	95 - 104
>07_019092441	(CA)16	ACATTGCACTAAAGGCATTC	20	TGTAATTTTCTGGCCTGAGT	20	55	288 - 298
>07_034093011	(CA)8	TAATTTACGGCTTCTTCTGC	20	CAGTACGCCTTCTGGATTAC	20	55	174

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chr.08

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>08_000420926	(CA)14	TAATAACACGGAGCACACAG	20	ACTTCAGCATCTGACAGTCC	20	55	108 - 139
>08_015006286	(CA)7	ATAATGCAGCAGCACACATA	20	TAAAGGCAACTCTTTTGAGG	20	55	240 - 246
>08_029494594	(CA)10	GGTTGCTTAAAAGCATTCTG	20	TGCATCTTTGTAAAGGCTCT	20	50	245 - 262

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chr.09

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>09_004046813	(CA)19	CATAGTTTTGGCTCCCTATG	20	CTTGTAGGTTGAGGGAAAAA	20	55	115
>09_015687066	(CA)12	TCCTGTTTTGAAGAGATGCT	20	TTTGAGCAAAGAGGTGTTCT	20	55	247 - 258
>09_023037290	(CA)24	TTTTCTTCCTGGTCACATTC	21	GACTTTCAATGGTGGAGTTC	20	55	138 - 146

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chr.10

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>10_000867825	(CA)12	GCCAAGATACAGAGAAGGAA	20	CCAGACACCAAAAATCTCAG	20	55	168
>10_011245908	(CA)9	TGGATATAGGAGGTGTTTATGC	22	AACTCGGTGTGAATCTGTTT	20	55	191 - 193
>10_020686172	(CA)11	GGTAATTAAGCTGCCTGCTA	20	ATTCACATCCTCCCTCCTAT	20	55	236 - 238

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chr.11

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>11_000473081	(CA)16	CTTCCCTCCATCCACACT	18	CTCTGCCCTTCCTTTTAGAG	20	55	243 - 246
>11_010316451	(CA)8	GTCAATAAGGAGCTGCAGAG	20	CAGGCAGATTTAGGAAACAG	20	55	189 - 204
>11_020832164	(CA)13	CACTGTGAGAAAATCACCAA	20	GCAACAGGAGAAAGACAAAC	20	55	120 - 137

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chr.12

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>12_000728518	(CA)7	ATGGTAACTGCAATGGAATC	20	ACGTTGATTACTCTGGTTGC	20	55	145 - 147
>12_009941025	(CA)8	ACATGATCCTGCTCAGAAAA	20	AGATGGAGTGGCATCATTAC	20	55	121
>12_020225082	(CA)7	AGCACATCAAATTACGTTCC	20	TGTTTCCTAACAGCACAGAA	20	55	259 - 281

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chr.13

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>13_000965020	(CA)11	ATCCTCACAGATAGCAGCAT	20	ACATCAGATCCCACAGCTT	19	55	225 - 234
>13_011188518	(CA)9	CTCTTTCTCCTAAGCGATGA	20	GGGGAATTACGGTTTCTATC	20	55	153 - 167
>13_017408391	(CA)16	TTCCTCCCTTTTGGTGAGTG	20	CAGTTGGCAGCTGAGAATCA	20	60	244

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chr.14

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>14_000500969	(CA)10	TCTGAATGTTGCTGTTGCTA	20	AAATGCTTGACTTTGTGGAG	20	50	98 - 105
>14_001910237	(CA)7	CAAGCCTCACACGGTGTCTA	20	TTGGGGACTGAAGAAGGTTG	20	55	290
>14_007438907	(CA)17	ATGACCCAATGTTGATCAGT	20	TGCTGTCACTGATTCTGAAA	20	55	172 - 193
>14_014752970	(CA)12	CACTGGGCTGAAGGTTTTGT	20	CGTGTGAACGGACTCTTCTG	20	60	276 - 289

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chr.15

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>15_000139064	(CA)9	GCCCTTGAAACATGACTATC	20	TCAGATGGGGAAAATACATC	20	55	106
>15_006172724	(CA)11	AGAAGTGGGTTTCTGATCCT	20	GCAAGACAATCCTTGCTAAA	20	55	147 - 161

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chr.16

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>16_000148392	(GT)8	TTCCAGCCCTTGCAATAAAC	20	TTAGCACCCCATTCTCAACC	20	55	251 - 259

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chr.17

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>17_000921245	(CA)7	TGCACTCAATCAGCAGGAAC	20	CTCCTGGCATTCCTTAGCAG	20	60	182 - 184
>17_010191322	(CA)7	AATAAGGAGGAAAGCAGGAG	20	CCTGTCTGCTCAAGTTCTTT	20	55	106

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chr.18

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>18_000787018	(CA)8	AAGAGCTCCTGATAACACCA	20	AGTTATCAGTGGGGATGTTG	20	55	171
>18_001728478	(CA)7	TTCTTACACCCTGCTTCTTC	20	CCACATCCATTGAGTCCTAT	20	55	195 - 198
>18_006798782	(CA)10	CGTTACCTGAGGTGCTCACA	20	AACTGCTGAGCTTGGGTTGT	20	55	70 - 72
>18_010102782	(CA)8	TATTAGGCCAATCTGCATTC	20	CAGAGCTGGTTTTCTTCCTA	20	55	142 - 156

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chr.19

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>19_001478787	(CA)10	CTCTCCGTGACCCAGTAAGC	20	GTTGGTATGGTGCCGAATCT	20	55	301 - 309
>19_003730647	(CA)15	CTACAAACCTTTCCCATCAC	20	GTACCACCTGCACTGAAACT	20	55	151
>19_009452694	(CA)8	CATTATGGGACGTTTCAACT	20	CCACGAGAGGATTTTACTTG	20	55	310 - 316

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chr.20

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>20_000620799	(CA)20	ACCCGATGGAACTGTTATTA	20	TGTATTTCCTGACTGCCTTT	20	55	125 - 127
>20_007011675	(CA)17	TGCTAATTCTAGGAGGATGG	20	CCAGGACTTTAAGAAATACTGC	22	55	122 - 124
>20_013106568	(CA)12	AAGCAAGAGAAATGGTGTGT	20	TTAAGCAGGTCCCTATACCA	20	55	204 - 208

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chr.21

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>21_000340098	(CA)12	TACAGACCACTCAAACAGCA	20	TTAATTATCCCCATGTCTGG	20	55	124 - 148
>21_006240251	(CA)9	AGCACTGTTCCTAATGGTGT	20	AATATGGAAAACAGGGAGGT	20	55	234 - 244

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chr.22

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>22_000080959	(CA)7	TTATCTGACTCCAGGACAGC	20	CATGTTTGGTGTGTTTTGAG	20	55	164
>22_003807885	(CA)7	TCCCAAGAAAAACCATCACG	20	GGCTCCCTTTAGCAACTCCT	20	55	134 - 136

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chr.23

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>23_000574159	(CA)8	GCATTCATATTTGTGCAGAC	20	ATGTTGCTGCACGTTTCT	18	55	176 - 199
>23_002807014	(CA)10	GTTCTGAACATCCAGCAGCA	20	ACAACCCATGCAATCTTTCC	20	60	248
>23_005539698	(CA)22	CGTCTTAATTACCAGCAAGG	20	CTGTCGCTGTCAGACTGTAA	20	55	202

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chr.24

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>24_000887291	(CA)7	TTGTTTGTGACAGAGATGGA	20	ACTTTCCCACCACTTTCTCT	20	55	169
>24_002462058	(CA)8	GGTCCATTTGGAGCTTCTCA	20	GGGGAGCTCTTAGTGCCTCT	20	60	198 - 199
>24_006343066	(CA)10	TTCCTTCCTTATACCCCTTC	20	AATTCTCAATCTGCCATCAG	20	55	193

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chr.25

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>25_000081230	(CA)12	ACAGACATTACATGCACACAC	21	AGCTCAATTAGCACAAGAGC	20	55	177 - 199
>25_001229511	(CA)8	AAGGAGTTGCCAAACCAAAT	20	CACAGTGCCATGTTCTGCTT	20	55	171 - 175

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chr.26

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>26_001218692	(CA)9	AAGTCTTGGTCCCTTTTCTC	20	CCAGCTCCTATGCATCTATC	20	55	267 - 288
>26_004650401	(CA)17	CCTTCTCCAGCTCCTTATG	19	ACAGGAAATACGCACAGAGT	20	55	232

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chr.27

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>27_001904060	(CA)10	CCAGCACTAAGTATGGCTTC	20	AGATGGGCTGCAAGTGTAT	19	55	147
>27_003893674	(CA)14	AGCTGCAGACCTCACAATCA	20	AACCCCAGAGAAAGCCAGAT	20	60	93 - 95

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chr.28

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>28_000385420	(CA)8	AGGAACAAAGCCAACACTT	19	CACCTCTGTCTGTGTCCTCT	20	55	134
>28_002639310	(CA)8	GAGGTCTTTGTATTCCCACA	20	TTCCTACAAGGCTCTCACAC	20	55	238 - 239
>28_003589311	(CA)9	TATTTCTGTGCTGCGTTTC	19	GTTCCGTGCTGGAAATAAC	19	55	116 - 144

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chr.Z

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>Z_002501282	(CA)12	ACTGCAGCAAGAGAAAACAT	20	ATGCTGAGCCCTCATTAAC	19	55	134
>Z_021605374	(CA)14	GCAACCCACAGACAGACAAA	20	CCACAGTACCAGCTGTGAGG	20	60	147
>Z_035289166	(CA)7	GGGCAGCTTGTCAGGATAAA	20	AATGGCCTTCTTCATCTCCA	20	60	302 - 333
>Z_043052730	(CA)7	TGCACAGATTAGGCAAATGG	20	TCTGCTGTGGTCAAATGGAG	20	60	167
>Z_043163050	(CA)17	GAGGCAGAGGAAAGAATTTGC	21	TGCATGAAGCATCACAAAGTT	21	60	262 - 279
>Z_051143622	(CA)7	CAGCTGGTGGAATCTGTTCA	20	TCTCAGCAGGGCTAGTGGTT	20	55	191 - 200
>Z_070620607	(CA)17	TCTGCTCTCACTCCTGCTGA	20	GAAGACAGAGGGCAAGTTGG	20	55	126

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chr.W

Locus Name	Number of CA repeats	Forward primer (5'-3')	Primer length (bp)	Reverse primer (5'-3')	Primer length (bp)	TA	Size range
>W_000064678	(CA)7	TTTGGTATTTCAGGGTATGC	20	TTAAGGAGTCTTCTGCTTGC	20	55	131

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