資源植物の構造と機能およびその環境応答機構に関する超微形態学的・生化学的・分子生物学的研究。

栽培植物の系統分化、形態形成、遺伝子発現および新機能開発に関する発育遺伝育種学的並びに生物工学的研究。

作物生産の生理・生態学的解析、とくに環境応答・資源獲得に関する研究。

水ストレス、塩ストレス耐性などに関わる生理・分子機構の解明、国内外の生物生産に関わるフィールドでの実証研究。

園芸作物の生産性向上のためのバイオテクノロジーおよび生理学・生化学・分子生物学的研究。特に、花器官の形成、開花、花色に関する生理、また、果実の結実生理および糖や二次代謝産物などの物質蓄積の解明とその制御。

植物病原菌の感染に対する作物の生体防御の機構と機能に関する生理学、生化学および分子生物学的研究。

植物－病原菌相関で誘導される植物免疫の分子機構に関する研究。

作物の遺伝情報、形態、生理特性、生産物の収量や品質、土壌や気象等の生育条件等の様々な情報を収集し、それらの関係性を情報学的手法で解析することで有益な情報を抽出し、品種改良や栽培管理の改善を通じて作物生産を向上させるための研究。

食料・農業問題に関する理論的・実証的研究および地域資源管理、農業の多面的機能に関する学際的研究。

高等植物における環境適応と生存戦略に関する分子生物学的研究。

高等植物の重要農業形質に関する分子遺伝学的研究、およびその応用をめざす分子育種的研究。

有用農業形質についての資源保存および形態形質に関する分子遺伝学的研究。