地下深く浸透したメタンは最終的に地下水層に到達すると考えられることより、愛知県下各地で農業用地下水を131点採取し、そのメタン濃度を測定したところ、半数以上の地下水試料からメタンが検出され、その平均メタン濃度は1.58mgC/L（最高18.4mgC/L）であった（図１８参照）。地下水を利用すれば溶存メタンは大気へ放出されることになり、その年間放出量は調査した地域（8.6万ha）の農業利用に伴って20.0ｔ、日本全体では約6.6千tにも達すると見積もられた。メタンの検出された地下水の水質（Eh, COD, Fe2+, Mn2+, NH4+, NO3-）と検出されなかった地下水水質は顕著に異なり、前者ではEh, NO3-濃度が低く他の項目は高い値であった。
- Watanabe, A., Kimura, M., Kasuya, M., Kotake, M. And Katoh, T. : Methane in groundwater used for Japanese agriculture: Its relationship to other physico-chemical properties and possible tropospheric source strength. Geophys. Res. Letters, 21, 41-44 (1994)
水田から発生するメタンの起源、メタンの土壌中での動態にもどる
2-6. 地下水利用に伴うメタンの放出