生物情報工学ＨＰ

 1. 生物情報工学概説 （担当　伊藤）

 2. 生物情報工学　I  （担当　伊藤）各種データベースの活用

 3. 生物情報工学　II （担当　芦苅）遺伝子配列解析

 4. 生物情報工学　III（担当　中野）タンパク質の高次構造解析

 

教員免許更新　 授業ファイル１

                             授業ファイル２

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データベースへのリンク

                  DDBJ(日本DNAデータバンク）

 

                  NCBI(Natioanl Center for Biotechnology Information)

 

                  日本蛋白質構造データバンク（PDBj: Protein Data Bank Japan）

                                                                                                                                                                                        

Link

                  Enzyme Nomenclature

 

                  大阪医科大学　Molecular Bioscience Sites　 

 

                  遺伝子万能解析サイト　All -IN-ONE SEQ-ANALYZER

 

                  大腸菌ベクターコレクション

 

                  NEBcutter (制限酵素による切断サイト解析）

 

                  WebCutter

 

                  ORF Finder

 

                  Primer3

 

                  Translate

 

                  Reverse Complement
Clustal W (EMBL)

 

                  SOSUI

 

                  SignalP

 

                    PSORT

 

                    The PredictionProtein server

 

                    Chou-Fasman

 

                    SWISS-MODEL

 

                    FAMS

 

 

Soft ware  

立体構造表示ソフト(PDB Viewer)

                  V 3.7 for Windows

 

                  V3.7  for MacOSX   

 

                  V3.7 for MacOS8-9

 

                  V 4.0 for MacOSX

 

                  V 4.0 for Windows

                   

授業用データ

 

                  Sample1

 

                  ベクターpBR322配列

 

                  EcoRV-DNA複合体

 

                  P.cepacia lipase
Lysozymes
Streptomyces antibioticus phospholipase D